口腔扁平苔蘚鏡下所見：在黏膜的白色條紋處，上皮有不全角化層；在黏膜發紅區則上皮表層無角化。棘層增生者較多，也有少數棘層萎縮。上皮釘突不規則延長，少數釘突尖端變成鋸齒狀?；准毎麑右夯?、變性，因此，基底膜常常界線不清，液化明顯者可出現上皮下皰。黏膜固有層見密集的淋巴細胞浸潤帶，浸潤范圍一般不達到黏膜下層，并與其下組織分界相對較清。在上皮的棘層、基底層或固有層可見膠樣小體，或稱Civatte小體，呈圓形或卵圓形，平均直徑為10um，為均質嗜酸性，PAS染色陽性呈玫瑰紅色，膠樣小體可能是凋亡的基底層細胞。